La ropa de los apestados la echaban al fuego y poco después las sustituyeron en la hoguera los herejes y científicos.
Se trata de una oración compuesta por coordinación copulativa. Contiene dos proposiciones con significado propio unidas por el enlace y.
En la P1: La ropa de los apestados la echaban al fuego el sujeto está elíptico, sería ellos ya que que concuerda con el verbo en número y persona. La ropa de los apestados funciona como complemento directo, así como el pronombre átono a que es usado para enfatizar. Al fuego es un complemento circunstancial de lugar.
En la P2: Los herejes y científicos realizan la acción verbal, por tanto es el sujeto. Las es un CD porque se refiere a las ropa de los apestados. La proposición está introducida por el Complemento Circunstancial de Tiempo poco después. En la hoguera funciona también como CC en este caso de Lugar.